موسسه های پژوهشی با داشتن برنامه پنج ساله مصوب هیات امناء و زیرساخت های لازم و تبدیل پژوهش های موردنیاز دستگاه های متقاضی به پروژه های پژوهشی می توانند دوره دکترای پژوهشی را اجرا کنند و دانشگاهها نیز به ازای هر 5 نفر دانشجوی دکترای آموزشی - پژوهشی می توانند یک نفر دانشجوی دکترا به شیوه پژوهش محور جذب کنند مشروط بر اینکه استاد راهنما طرح پژوهشی تقاضا محور داشته باشد.