دانشجو پس از تصويب طرح پيشنهادي رساله موظف است در هر نيمسال درس رساله را اخذ نمايد. در اين مرحله، دانشجو مجاز است در زمان تدوين رساله دکتري و براي ادامه فعاليتهاي پژوهشي خود، با نظر استاد راهنما و طبق آيين نامه مصوب وزارت در مدت مجاز تحصيلي با عنوان فرصت تحقيقاتي به يکي از مؤسسه‌هاي آموزش عالي داخلي يا خارجي سفر کند. همچنين، طي مرحله انجام رساله، دانشجو موظف است هر شش ماه يکبار با ارائه گزارش کتبي و سمينار شفاهي در حضور استاد/استادان راهنما، استاد/استادان مشاور، حداقل يک نفر داور و مدير گروه يا نماينده وي به عنوان ناظر، روند پيشرفت انجام تحقيق خود را به تأييد کميته مذکور برساند.